【植物形态】植株全部无毛。茎高60-200厘米，分枝。基生叶在开花时枯萎。茎下部和中部叶为三至四回羽状复叶；叶片长达40厘米；小叶草质，大小变异很大，顶生小叶圆卵形、倒卵形或椭圆形，长0.5-3厘米，宽0.3-2（-2.5）厘米，基部圆形或楔形，三浅裂或不分裂，裂片全缘或有1-3齿，脉平或在背面稍隆起，脉网不明显；叶柄长1.4-8厘米，基部有鞘；托叶半圆形，边缘分裂或不裂。圆锥花序长15-40厘米；花梗细，长0.8-2.5厘米；萼片4（-5），淡紫色，卵形或狭卵形，长5.5-9（-12）毫米，宽2.2-4.5（-5）毫米，顶端急尖或微钝；雄蕊多数，长5-7毫米，花药长圆形，长约1.5毫米，顶端短尖头长0.1-0.2（-0.4）毫米，花丝近丝形，上部稍宽；心皮15-22，子房基部变狭成短柄，花柱短，柱头生花柱腹面。瘦果扁，斜倒卵形，有时稍镰刀形弯曲，长5-8毫米，宽2.5-3.2毫米，约有8条纵肋，沿腹棱和背稜有狭翅，柄长1-3毫米，宿存花柱长约1毫米。6-9月开花。
【生境分布】产云南、西藏东部（林芝以东）、四川西部。生海拔1900-3400米间山地林边、沟边、灌丛或疏林中。
【药用部位】以根及根茎入药。
【采收加工】春、秋季采挖，抖去泥沙，除去苗茎，晒干。
【性味】苦，寒。
【功能主治】清热燥湿，泻火解毒。主湿热泻痢，黄疸，白带，风火牙痛，目赤肿痛，疮疡肿毒。
【用法用量】内服：煎汤，0.5～3钱。根代黄连用可治风火牙痛、眼痛等症。
【附方】治小儿伤风发热及麻疹将出：马尾黄连、蝉蜕、菊花、大力子、防风、薄荷、甘草，煎汤服。《四川中药志》；治痢疾，肠炎：马尾黄连九钱，木香三钱。共为细末。每次一至二钱，一日三次服。《新疆中草药手册》；治湿热呕吐：马尾连一钱半，吴茱萸四分，煎服。《青海常用中草药手册》；治热病烦渴：马尾连、焦山栀各三钱，煎服。《青海常用中草药手册》；治口舌生疮，结膜炎，扁桃体炎：马尾黄连三钱，黄芩二钱，刺黄柏三钱，栀子三钱，牛蒡子二钱，连翘五钱，甘草二钱。水煎服。《新疆中草药手册》；治红肿疮痈：马尾黄连二钱，水煎服及研末外撒或制成软膏外用。《云南中草药》；治渗出性皮炎：马尾黄连适量，焙干研末，撒患处。或与松花粉各等分同用。如撒后患处于燥起裂，可用香油调敷。《新疆中草药手册》；治脚癣：马尾黄连五钱，黄柏一两，新鲜猪胆汁一个，冰片三分。先将马尾黄连、黄柏水煎成糊状，去渣，再下猪胆汁，微火煎1~2分钟，离火，待温加冰片搅匀，每晚擦患处。《新疆中草药手册》。
【摘录】《中国植物志》、《中华本草》、《中药大辞典》、《中药材大全》。